Magyarországon több őshonos hüllőfaj él, amelyek közül néhány védett és különleges természetvédelmi értékkel bír. Az alábbi lista a Magyarországon előforduló hüllőfajokat tartalmazza:
Kígyók
- Keresztes vipera (Vipera berus)
- Elterjedése: Főként az Északi-középhegység területein található.
- Védettségi státusz: Védett
- Rákosi vipera (Vipera ursinii rakosiensis)
- Elterjedése: Alföldi gyepeken él.
- Védettségi státusz: Fokozottan védett
- Rézsikló (Coronella austriaca)
- Elterjedése: Szárazabb, napos területeken fordul elő.
- Védettségi státusz: Védett
- Vízisikló (Natrix natrix)
- Elterjedése: Tavak, folyók, mocsarak közelében.
- Védettségi státusz: Nem védett
- Kockás sikló (Natrix tessellata)
- Elterjedése: Vízparti környezetekben él.
- Védettségi státusz: Védett
- Sima sikló (Coronella austriaca)
- Elterjedése: Erdei tisztásokon, sziklás területeken.
- Védettségi státusz: Védett
- Erdei sikló (Zamenis longissimus)
- Elterjedése: Főként erdős területeken található.
- Védettségi státusz: Védett
Gyíkok
- Zöld gyík (Lacerta viridis)
- Elterjedése: Mezőkön, ligetekben, erdőszéleken.
- Védettségi státusz: Védett
- Fali gyík (Podarcis muralis)
- Elterjedése: Kőtörmelékek, sziklás területek közelében.
- Védettségi státusz: Védett
- Fürge gyík (Lacerta agilis)
- Elterjedése: Homokos, füves területeken.
- Védettségi státusz: Védett
- Pannon gyík (Ablepharus kitaibelii fitzingeri)
- Elterjedése: Száraz, meleg lejtőkön.
- Védettségi státusz: Fokozottan védett
- Törékeny gyík (Anguis fragilis)
- Elterjedése: Erdei talajon, avarban.
- Védettségi státusz: Védett
Teknősök
- Mocsári teknős (Emys orbicularis)
- Elterjedése: Mocsaras, vizes élőhelyeken.
- Védettségi státusz: Védett
Magyarországon ezek a hüllőfajok kiemelt figyelmet és védelmet érdemelnek, hiszen sokuk élőhelye veszélyeztetett, és a populációik csökkenő tendenciát mutatnak. Az élőhelyek megőrzése és a fajok védelme érdekében fontosak a természetvédelmi intézkedések és a lakosság környezettudatos szemléletének növelése.